
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
理论研究最后
论述员蜡烛燃烧实验不断地保温的时光不断延长羊肉片的硬性、持水力发电、色彩、悬浮铁浓度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4层次来评定腹肌安排肿瘤细胞系的铁死方式。结局现示,保温的时光不断延长后,羊肉片的硬性在第8天和第6天有明显缩减;持水技能缩减;背景颜色变深,抛弃有光泽度,鲜橙大红色变的暗橙大红色。于此,悬浮铁、活力氧和MDA的浓度有明显延长,肿瘤细胞系凋亡率有明显身高。 实验拜谱生物提炼不相同冷冻时的肌试品的蛋清质,其次采取SDS-PAGE概述,蛋清质条带在不相同五代十国时期数据分布饱满且相像(图1a)。结合蛋清在不相同试品中的形容原因,概述挖掘相一模一样组试品的中六位数比较敏感于相一模一仿品质(图1b),说肌试品蛋清质具备着非常好的组内相像性和组间对比性。 营养物质质组学共检测出1996种营养物质质。以B0为比组,淘汰B1、B2、B4和B6中的营养物质做好差异性化表述出分享,共检测到375个DEPs。将火山图信息可视化,并选择FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个标准规范分享DEP。毕竟如图已知1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检测出22、33、73和140个DEPs,另外分刘海别上涨6、11、32和815个,再降16、22、41和54个。聚类分析法做法分析了不一冰箱阶段中,胸肌团体中营养物质质的表述出,毕竟体现胸肌营养物质表述出差异性化如今处理时间间隔的增长而增长(图1g)。
图1| 不一冰箱时的相关肌肉备样蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同要在冷藏室保存日期的胸肌供试品不一致性球蛋白进行分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频球蛋白肽的PRM定量了解了解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 对于KEGG聚集距离传达蛋清的铁消亡长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT按量蛋清质组学科技货品,拜谱生物体已研究开发完毕并构建了加强制度建设旺盛期的转录组学、蛋清组学、产生组学已经多个学连合货品科技货品制度,欢迎致电咨询!
符合论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.