
2024年9月由杭州现代农业上大学张万刚教学人员在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱微生物为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版副标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
学术期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2028年影响到成分:5.7
发表论文精力:2024年9月
企业客户公司:南京农业大学
研究方案文件:蛋白
拜谱提供数据技术水平:亚硝基化修饰组学
系统行车路线:
一、探析成果
01.Caspase-3活性氧
到目前为止尚不看不清楚NO对caspase-3的抑制性功用可否归因于NO介导的S-亚硝基化,各个溶度均值的GSNO对于外源性NO供应商,以诱发caspase-3的离体S-亚硝基化。结局证实,与无GSNO的组较之,100、200和400μM GSNO组的caspase-3灵生物重要变低(图1),与此前新闻报导不一样。GSNO加工变低caspase-3灵生物的自身其原因仍尚需相一致。
图1 不一氧浓度的GSNO正确处理对caspase-3几丁质酶的反应
02.Caspase-3的S-亚硝基化层面
学习Caspase-3的亚硝基化水平,以系统阐述GSNO对Caspase-3的症状性。经GSNO办理后,判断到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化抗压强度加剧(图2)。这结杲揭示,外源性GSNO提升可完美诱骗caspase-3的身体之外S-亚硝基化。惹人惊愕的是,在不会GSNO有着的参考组中判断到这个较弱的S-亚硝基化带,这揭示caspase-3几率再次发生内源性的S-亚硝基化。与此同时,本学习中caspase-3的S-亚硝基化水平较高,而caspase-3的几丁质酶降,这与以往的学习保持一致。然后,caspase-3的特异形S-亚硝基化绘制位点尚不看不清楚,还需进步的摸索。
图2 GSNO治理 对caspase-3S-亚硝基化质量的影晌
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化体现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文编码序列。橙色符号的回文编码序列表达出来S-亚硝基化肽,红白色符号的C表达出来S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3溶解结蛋清
结血清做的很关键性的人体组织骨架血清,在长期保持肌人体组织组成的组成完全性和拉伸性等方面起着很关键性的能力,学习S-亚硝基化caspase-3对结血清溶解的脆弱性体现了很关键性现实意义。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的初始值肌弹性弹性纤维血清)组比起来,0 μM GSNO组(肌原弹性弹性纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完全结血清含铁同质性调低,提升caspase-3对结血清体现了隐藏的的血清溶解的能力。在GSNO孵育后,完全结血清的含铁强烈加入(P < 0.05)。于此,当GSNO盐浓度身高时,完全结血清的含铁持续不断上浮(P < 0.05)(图5)。这些察觉得出结论,SNO掩盖的caspase-3以质量根据的方式促使结血清的溶解。
图5.S-亚硝基化caspase-3吸附结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3分解肌钙球蛋白-T
肌钙球蛋清酶-T (TnT)是原肌球球蛋清酶调试主要负责身体肌肉拉伸的丝条的必须肌原棉钎维球蛋清酶。TnT的光挥发表现形式是监测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化状况下,caspase-3对TnT的光挥发实际情况如图甲图示6图示,与Std组(包括caspase-3和GSNO的肌原棉钎维)不同于,caspase-3组中30 kDa TnT片断不错加剧,反映caspase-3直接参与了TnT的光挥发,虽然,caspase-3与GSNO的孵育引发30 kDa TnT变少。在100和200 μM GSNO组内不监测到显眼的对比分析(P > 0.05),而当GSNO的含量达到了400 μM 时,该片断不错变少(P < 0.05)。某些看到反映了SNO体现的caspase-3对TnT光挥发的控打造用。结球蛋清酶和TnT是caspase-3的特别敏感底物,而GSNO清理减轻了caspase-3的渗透性将会引发肌原棉钎维球蛋清酶光挥发水平减轻了。与此同时所论,NO诱导型的S-亚硝基化就能够使用体现半胱氨酸残基来调试caspase-3的渗透性,以求进一部应响到其对结球蛋清酶和TnT的球蛋清酶淀粉水解性能,若想应响到羊肉品质质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3溶解肌钙蛋清-T
二、个人总结
本研究方案我委浅议S-亚硝基化对caspase-3掩盖的损害和后来对牛肉片片肌原仟维身体外分解的损害。蛋清质S-亚硝基化能能掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,才能造成的caspase-3催化活性影响,进1步治理和改善了其对牛肉片片肌原仟维蛋清质的蛋清质油脂水解能力素质。三、拜谱总结ppt
调查主要采用了酶活判断,亚硝基化表达组学数据分析,WB等检则方式,发掘球膳食纤维质质S-亚硝基化会表达caspase-3的半胱氨酸残基,这引致了caspase-3活性酶的降低,相结1步抑制作用了其对牛羊肉肌原化学纤维球膳食纤维质质的球膳食纤维质质溶解技能。本调查为理解球膳食纤维质质质亚硝基化对肉肥的房产调控系统供给好几回个新的第一人称视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球高蛋白酶组学、突显球高蛋白酶组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系例好产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total空气氧化展现、氧化钙含量巯基,欢迎大家咨询!
参考价值学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663