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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T内部能掌握肿癌内部界面的具体策划 相融性复合材料体(MHC)呈递的抗原而激发天然免疫抗体性体现。MHC I类(MHC-I)原子与CD8+ T内部共同反应,其呈递的肽具体源头于内源性胞质球球蛋白质的球球蛋白质酶体化学吸附,而MHC II类(MHC-II)原子具体展示于专业技术抗原提呈内部,与CD4+ T内部共同反应,其呈递的肽存在根据内体可行途径化学吸附的胞外和胞内球球蛋白质(图1)。因为,掌握由MHC原子呈递的肿癌抗原针对于结构设计依耐T内部掌握和处理肿癌内部的可行和防护的肝癌天然免疫抗体性治疗法是至关很重要的。立于质谱(MS)的天然免疫抗体性肽组学(Immunopeptidomics)能从多重内部系、肿癌策划 和身心健康策划 中高通芯片量、之间监定MHC运用肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC以及切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽编码序列或泰语翻译后掩盖信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从后测序方法,不依赖现有数据库,更多通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且充沛的数剧解析內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递癌肿抗原的途经

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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拜谱生物阐述

01 新机制探究

篇文章考题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发过报纸:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)就是种核所在蛋白质,在癌症复发中隔三差五过表示,做以为淋巴肿瘤的发生的驱使重要因素。近年来,靶向治疗XPO1的小碳原子正被代替诊疗抗肿瘤药剂。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 属于起源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-免役医治

篇文章标题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发表文章自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023

恶劣胸膜间皮瘤(MPM)不是个种继发性不当的肉瘤样癌性肉瘤。随着当前的制疗策划方案缺失较果,往往迫切希望都要新的制疗攻略。上述情况其T受损细胞侵润性,诗人比如MPM不是个个该用的制疗性肠癌预防针的方向。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用场景质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫力肽组学加测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 真菌mRNA防疫针开发设计

本文大题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

发布报刊内容:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过立于质谱的免疫检测肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌影响的Hela体細胞和HCT-116体細胞中认定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结ppt

抗体抗体性抗体力企业肽组学是核脂肪酸组学的一家加快发展前景的结点,它精益求精于设计抗体抗体性抗体力企业设备中由最主要企业化相融性软型体(MHC)或人类白企业抗原(HLA)碳原子呈递的抗体抗体性抗体力企业肽。等等抗体抗体性抗体力企业肽是企业外层呈递的肽段,可被T企业辨别,所以解锁抗体抗体性抗体力企业生理特点反应。对于质谱的抗体抗体性抗体力企业肽组学都已经 拥有检测结论MHC核淀粉酶呈递肽的金标准的方式 ,可进行检测结论不相同生理特点和病症环境下不相同企业化和企业类别中的抗体抗体性抗体力企业肽组,列如实体化瘤或木马传染的企业。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫检查测量肽组检查测量服务保障,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,也能精准且同时提供数据抗体检测肽编码序列,感觉许多非典型案例抗体检测肽,层层落实挑选出可靠的新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

可以参考学术论文

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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